2016年4月30日 星期六

Long Noncoding RNA (lncRNA) in Cancer

Long noncoding RNA (簡稱lncRNA,發音 "link" RNA) 翻譯成中文就是長非轉譯核醣核酸。顧名思義就是,轉錄但不轉譯成為amino acid的一段相對很長的RNA。定義上來講,lncRNA是一段大於200 bp且沒有轉譯潛能的一段RNA



重要性

  • 最近研究發現lncRNA有不錯的tissue or cancer specificity,也就是說只有在特定的組織或腫瘤會表現出來或有較高的表現量。


臨床應用
能夠成為疾病的biomarker,可助於prognosis的評估,也能作為treatment-response的predictor


  • 其中一個名為HOTAIR的lncRNA,發現在早期乳癌中其表現量和survival有負相關性 (當初surgically-resected primary tumor中的表現量愈高,之後的 survival也就愈差) (Nature. 2010 Apr 15;464:1071-6.)





  • 甚至有人發現在卵巢癌中,HOTAIR的表現量和對carboplatin的sensitivity有相關性 (Genome Med. 2015; 7: 108)






  • 在攝護腺癌中,名PCA3的lncRNA經過美國National Cancer Institute主持的validation trial後,發現相較於傳統的serum PSA,檢測尿液中的PCA3能更準確的預估是否有惡性腫瘤。PCA3是第一個FDA審核通過的lncRNA-based檢驗項目。 (J Clin Oncol. 2014 Dec 20; 32(36): 4066–4072.)




參考文獻

  1. Schmitt, Chang. Long Noncoding RNA in Cancer PathwayCancer Cell. 2016 Apr 11;29(4):452-63. (Review article)
  2. Gupta et al.(2010). Long non-coding RNA HOTAIR reprograms chromatin state to promote cancer metastasis. Nature 464, 1071–1076.
  3. Teschendorff et al. (2015). HOTAIR and its surrogate DNA methylation signature indicate carboplatin resistance in ovarian cancer. Genome Med. 7, 108.
  4. Wei et al. (2014). Can urinary PCA3 supplement PSA in the early detection of prostate cancer? J. Clin. Oncol. 32, 4066–4072.